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生物科学

单细胞组学基础

作者：樊龙江著

出版社：科学出版社出版时间：2024-11-01

开本：其他页数： 262

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版权信息
内容简介
目录

单细胞组学基础版权信息

ISBN：9787030793447
条形码：9787030793447 ; 978-7-03-079344-7
装帧：一般胶版纸
册数：暂无
重量：暂无
所属分类：
自然科学
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生物科学

单细胞组学基础内容简介

本书系统介绍了一门全新的学科领域——单细胞组学的概念、技术及其数据概况。重点梳理和介绍了单细胞组学高通量测序技术及其数据分析方法，具体包括单细胞捕获、扩增和测序技术、各类组学数据生物信息学分析内容、算法及其主要软件工具。

单细胞组学基础目录

目录序前言本书使用说明**章绪论 1**节单细胞组学概述 1一、单细胞组学概念与研究对象 1二、单细胞组学发展历史 8第二节单细胞组学技术优势及其应用 13一、技术优势及其覆盖领域 13二、领域应用概况 14第三节单细胞组学展望与挑战 17一、单细胞组学发展趋势 17二、单细胞组学面临的主要挑战 18学科先锋我的导师汤富酬 19第二章单细胞分选与测定技术 21**节单细胞样本制备 21一、样本类型与要求 21二、悬液制备及分选 23第二节单细胞转录组测序文库制备与测序技术 28一、单细胞转录组测序文库制备 28二、单细胞转录组测序技术 29第三节单细胞基因组及表观组测序技术 35一、单细胞基因组测序技术 35二、单细胞三维基因组测序技术 40三、单细胞表观组测序技术 42第四节单细胞蛋白质组和代谢组测序技术 46一、单细胞蛋白质组测序技术 46二、单细胞代谢组测序技术 50学科先锋我的导师David Weitz 52第三章空间组学成像与测定技术 54**节单细胞空间转录组学技术 54一、单细胞空间转录组学技术原理 54二、单细胞空间转录组实验流程 60第二节其他空间组学技术 65一、空间基因组学技术 65二、空间代谢组学技术 67三、空间多组学技术 68学科先锋超高分辨率时空组学技术Stereo-seq横空出世 73第四章单细胞转录组数据基础分析 75**节测序数据预处理、比对与表达定量 75一、测序数据基本分析流程 75二、条形码和UMI分析 76第二节表达矩阵质控与优化 78一、质控 78二、标准化与归一化 83三、数据优化 85第三节特征基因选择、降维与聚类 88一、特征基因选择 88二、降维 89三、聚类 90第四节标记基因鉴定与细胞类型注释 90一、标记基因鉴定 90二、细胞类型注释 91学科

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