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临床试验的统计学设计、监查和分析——原理与方法(第2 版)

临床试验的统计学设计、监查和分析——原理与方法(第2 版)

作者:姚晨
出版社:北京大学医学出版社出版时间:2024-06-01
开本: 其他 页数: 316
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临床试验的统计学设计、监查和分析——原理与方法(第2 版) 版权信息

临床试验的统计学设计、监查和分析——原理与方法(第2 版) 本书特色

《临床试验的统计学设计、监查和分析——原则与方法》(第2版)着重探讨了临床试验的生物统计学内容。 本书的内容建立在作者过去20年为公共卫生和临床医学生、住院医师以及研究人员所教授的课程基础上,详细阐述了临床试验中生物统计学如何与多种基本科学原理和统计学方法相结合。本书首先介绍了临床试验中的伦理和安全性基本原则、试验设计核心概念、样本量和把握度计算的原则和方法,以及协方差分析和分层分析。随后详细说明了两阶段II期肿瘤临床试验至III期成组序贯试验的序贯设计和方法,包括安全性、无效性和有效性监查。作者进一步讨论了样本量重新估计、适应性成组序贯设计、II/III期无缝设计,以及具有预测性生物标志物的试验设计。此外,本书还涵盖了多重检验方法的应用、估计目标和伴发事件的概念,以及不同的缺失数据处理方法。书中还描述了如何使用适当的多重插补来分析不完整数据。 本书从临床试验的学术研究、商业开发和公共卫生角度出发,旨在为学生和从业者提供一个多学科的视角,帮助他们理解设计、监查和分析各种类型试验的概念和技术。本书适于(生物)统计学、流行病学、医学、药学以及其他公共卫生领域的学生和研究人员阅读参考。

临床试验的统计学设计、监查和分析——原理与方法(第2 版) 内容简介

本书详细阐述了临床试验中生物统计学如何与多种基本科学原理和统计方法相结合。首先介绍了临床试验中的伦理和安全性基本原则、试验设计核心概念、样本量和把握度计算的原则和方法,以及协方差分析和分层分析。随后详细说明了两阶段Ⅱ期肿瘤临床试验至Ⅲ期成组序贯试验的序贯设计和方法,包括安全性、无效性和有效性监测。作者进一步讨论了样本量重新估计、适应性成组序贯设计、Ⅱ/Ⅲ期无缝设计,以及具有预测性生物标志物的试验设计。此外,本书还涵盖了多重检验方法的应用、估计目标和伴发事件的概念,以及不同的缺失数据处理方法。书中还描述了如何使用适当的多重插补来分析不完整数据。

临床试验的统计学设计、监查和分析——原理与方法(第2 版) 目录

目录 1 概述 1 1.1 什么是临床试验 1 1.2 良好实验的要求 2 1.2.1 以一个古老的故事作为示例 2 1.2.2 临床试验的基本步骤 3 1.2.3 临床试验方案的基本组成部分 4 1.2.4 对设计良好的研究的界定和方案评价指南 4 1.3 伦理和安全** 6 1.3.1 《纽伦堡法典》(1947)和《赫尔辛基宣言》(1964) 7 1.3.2 《贝尔蒙特报告》(1976) 7 1.3.3 知情同意 7 1.3.4 讨论 8 1.4 临床试验的分类 8 1.4.1 按医疗干预划分 8 1.4.2 按疾病或治疗领域划分 9 1.4.3 以药物研发阶段作为试验阶段划分 9 1.4.4 按疾病存在(治疗性试验)或不存在(预防性试验)划分 12 1.4.5 按设计特征划分 12 1.4.6 按假设和统计推断划分 13 1.5 临床试验中的多学科团队合作 13 附录 1.1 知情同意的要素 13 作业 1.1 15 作业 1.2 18 作业 1.3 18 参考文献 18 2 统计设计的概念和方法 20 2.1 外部真实性 20 2.2 内部真实性 22 2.3 可重复性 23 2.4 向均值回归现象和同期对照组的重要性 23 2.4.1 向均值回归——定义和示例 24 2.4.2 向均值回归作为偏倚的影响 24 2.5 随机样本和样本随机化 26 2.5.1 什么是随机化 27 2.5.2 为什么要随机化 27 2.5.3 随机化和设盲的逻辑 27 2.5.4 随机化过程 28 2.6 随机化方法 28 2.6.1 接近随机化设计 28 2.6.2 区组随机化 29 2.6.3 分层随机化 29 2.7 *小化法 29 2.8 患者人口统计学和基线特征表 31 作业 2.1 33 作业 2.2 33 作业 2.3 33 作业 2.4 33 参考文献 35 3 试验设计的统计学效率和交叉设计 37 3.1 试验设计的统计学效率 37 3.2 交叉设计 38 3.3 2×2 交叉设计的分析 39 附录 3.1 等方差假设下 1 ∶ 1 分配的统计学效率 41 附录 3.2 方差不等时的很优分配方式 42 附录 3.3 针对反应人数的优化 43 作业 3.1 44 作业 3.2 44 作业 3.3 44 作业 3.4 44 参考文献 45 4 样本量和把握度计算 46 4.1 基础知识和一般公式 46 4.2 连续型结局均值的比较 48 4.3 二分类结局百分率的比较 51 4.4 时间 - 事件(生存)终点的比较 53 4.4.1 结局事件 53 4.4.2 包括和不包括删失的指数分布模型 53 4.4.3 Weibull 分布下的 log-rank 检验 56 4.4.4 比例风险模型下的 log-rank 检验 56 4.5 整群(或相关)样本 57 4.6 非劣效性或等效性检验的样本量估计 59 4.7 采用 Wilcoxon-Mann-Whitney 检验进行等级终点的比较 63 4.8 调整样本量 64 4.8.1 针对失访的调整 64 4.8.2 针对受试者不依从研究干预的调整 65 4.8.3 针对失访和受试者不依从研究干预的调整 65 4.8.4 针对多重检验的调整 65 4.9 通过模拟或 Bootstrap 计算样本量 66 附录 4.1 2×2 交叉设计的样本量 66 附录 4.2 生存数据分析概要 67 附录 4.3 指数分布模型 68 附录 4.4 包含独立删失的情况 69 附录 4.5 指数模型下包含删失的优选似然估计 70 附录 4.6 通过 SAS 的 POWER 过程计算 log-rank 检验的样本量和把握度 71 作业 4.1 71 作业 4.2 72 作业 4.3 72 作业 4.4 72 作业 4.5 73 作业 4.6 73 作业 4.7 73 作业 4.8 74 参考文献 76 5 协方差分析与分层分析 77 5.1 数据分析原则 77 5.2 连续型结局变量——ANOVA 和 ANCOVA 78 5.2.1 等斜率检验 79 5.2.2 等斜率 ANCOVA 模型 80 5.2.3 使用 SAS 进行 ANCOVA 分析 81 5.3 通过协变量减小方差 82 5.4 分层分析 83 5.5 logistic 回归分析 85 5.5.1 二分类结局变量和 logistic 回归 85 5.5.2 有序多分类结局变量和累积 logit 模型 86 附录 5.1 每周平均疼痛评分(WAPS)数据 90 附录 5.2 瑞德西韦用于治疗 COVID-19 患者(6 级量表数据) 92 附录 5.3 使用 SAS 程序对附录 5.2 的数据进行 logistic 回归分析 105 作业 5.1 107 作业 5.2 107 作业 5.3 108 参考文献 109 6 生存数据的回归分析 110 6.1 未校正处理效应的 Kaplan-Meier 估计与 log-rank 检验 110 6.2 Cox 回归分析和比例风险模型 111 6.3 回归系数的解释 113 6.4 基于偏似然的回归系数的推论 113 6.4.1 偏似然函数 113 6.4.2 log-rank 检验和分层 Cox 回归模型 115 6.5 基线累积风险估计和生存函数估计 115 6.6 模型诊断的残差 116 6.6.1 鞅残差 116 6.6.2 伪观察值和伪残差 117 6.7 非比例风险的方法 118 6.7.1 加权 log-rank 检验 G(ρ,γ)不同组合中的优选值 118 6.7.2 加权 Cox 回归的平均风险比 119 6.7.3 使用伪观察的 GEE 估计平均生存时间(RMST) 121 附录 6.1 数据集 sorafos 123 附录 6.2 使用 SAS PROC LIFETEST 绘制 Kaplan-Meier 图 124 附录 6.3 使用 SAS PROC LIFETEST 绘制 log(-logS(t))对 log(t)的图 124 附录 6.4 将 SAS 数据集导出到 R 124 附录 6.5 使用 R 程序进行 log-rank 检验以及绘制 Kaplan-Meier 图 125 附录 6.6 在 R 包中用 coxph 做 Cox 回归分析,用 cox.zph 做比例风险检查 125 附录 6.7 使用 SAS PROC PHREG 进行分层 Cox 回归分析 126 附录 6.8 使用 SAS PROC PHREG 的绘图和检验功能进行残差分析 126 附录 6.9 使用 R 中的 coxphw 进行非比例风险(NPH)的加权 Cox 回归 128 附录 6.10 使用 R 中的 coxphw 进行多于一个处理组协变量(存在非比例风险)的加权 Cox 回归 129 附录 6.11 使用 biofeedback 数据集和 R 中的 survRM2 通过 IPCW 方法对非比例风险(NPH)数据进行 RMST 分析 131 附录 6.12 使用 SAS PROC RMSTreg 对非比例风险 (NPH) 数据进行 RMST分析 132 作业 6.1 132 作业 6.2 132 作业 6.3 133 作业 6.4 133 作业 6.5 133 作业 6.6 133 作业 6.7 133 作业 6.8 133 作业 6.9 133 作业 6.10 134 参考文献 134 7 序贯设计和方法——**部分:预期样本量和二阶段Ⅱ期肿瘤临床试验 137 7.1 优选样本量和预期样本量 137 7.2 Ⅱ期肿瘤临床试验中的单阶段设计和二阶段设计 138 7.2.1 概述 138 7.2.2 复习二项分布并使用 R 程序进行单样本情形下的样本量估计 139 7.2.3 二阶段设计的例子 140 7.3 Simon 二阶段设计 142 7.3.1 很优化设计 142 7.3.2 极大极小设计 143 7.4 讨论 143 7.4.1 软件 143 7.4.2 p 值 143 7.4.3 其他问题 144 作业 7.1 144 作业 7.2 144 作业 7.3 145 作业 7.4 145 作业 7.5 145 参考文献 146 8 序贯设计和方法——第二部分:对安全性和治疗无效的监测 147 8.1 安全性监测 147 8.1.1 不良事件 147 8.1.2 监测严重不良事件的贝叶斯方法 149 8.1.3 Beta 二项分布模型 149 8.1.4 Beta 分布形状参数(a,b)的推导 152 8.1.5 讨论 153 8.1.6 采用 Gamma-Poisson 分布监测罕见的严重事件 153 8.2 采用条件概率进行无效性监测 155 8.2.1 二阶段监测的流程 156 8.2.2 讨论 158 附录 8.1 采用 A 方法求解先验分布 beta(a,b)参数的 R 程序 158 附录 8.2 采用 B 方法求解先验分布 beta(a,b)参数的 R 程序 159 附录 8.3 关于二阶段监测过程的注释 160 作业 8.1 161 作业 8.2 162 参考文献 162 9 序贯设计和方法——第三部分:经典成组序贯试验 164 9.1 关于试验监查的监管要求和管理考量 164 9.2 统计方法 166 9.2.1 基本原理 166 9.2.2 间隔相同的成组序贯设计边界值 167 9.2.3 **类错误消耗 / 使用函数方法 169 9.2.4 类 Pocock、类 OBF 和其他类型的连续性边界值 171 9.3 把握度、信息量和漂移参数 173 9.4 试验终止时的 p 值 175 9.5 处理效应估计 176 附录 9.1 计算第二次(终点)分析边界值的 R 程序 qfind 177 附录 9.2 关于独立增量偏加和过程的进一步解析 178 附录 9.3 信息时间 / 比率、优选耗时试验以及优选信息量试验 179 作业 9.1 181 作业 9.2 181 作业 9.3 181 作业 9.4 181 作业 9.5 182 作业 9.6 182 作业 9.7 182 作业 9.8 182 参考文献 182 10 监测优选信息和适应性样本量设计 185 10.1 适应性设计的概述 186 10.2 适应性样本量设计——样本量再估计(SSR) 186 10.2.1 非比较分析后进行的 SSR 187 10.2.2 比较分析后进行的 SSR 188 10.3 监测具有生存终点的研究的试验持续时间 195 10.4 经典成组序贯设计α 消耗函数方法的改进 198 10.5 适应性成组序贯方法——改变不依赖于非盲态的期中数据 199 附录 10.1 202 附录 10.2 204 附录 10.3 205 作业 10.1 207 作业 10.2 207 作业 10.3 207 作业 10.4 207 作业 10.5 207 作业 10.6 208 作业 10.7 208 参考文献 209 11 多重性问题和控制**类错误率的方法 211 11.1 通用符号和总错误率 211 11.2 多个终点和疗效获胜标准 213 11.3 常用方法 213 11.3.1 Bonferroni 方法 213 11.3.2 Holm 方法 214 11.3.3 Hochberg 方法 214 11.3.4 Holm 方法的推广 215 11.3.5 图形链方法的更新算法 217 11.4 两个零假设族的图形链方法 218 11.5 监测成组序贯试验中的多个终点 219 附录 11.1 222 附录 11.2 222 作业 11.1 224 作业 11.2 224 作业 11.3 224 作业 11.4 225 参考文献 225 12 具有预测性生物标志物的临床试验 226 12.1 基本概念 226 12.2 无分类错误情况下的设计和假设 227 12.2.1 靶向和非靶向设计 227 12.2.2 标志物分层设计 227 12.2.3 精准医学设计 229 12.3 分层设计与精准医学设计的比较 229 12.3.1 分层设计更高效 229 12.3.2 测试生物标志物的临床效用 230 12.4 适应性富集设计 231 12.5 存在错误分类时的设计与假设 233 12.5.1 靶向设计和非靶向设计 233 12.5.2 标志物分层设计 234 12.5.3 精准医学设计 235 12.5.4 适应性富集设计 236 作业 12.1 237 作业 12.2 237 作业 12.3 237 作业 12.4 237 作业 12.5 237 参考文献 238 13 Ⅱ / Ⅲ期无缝设计——选择优胜者设计 240 13.1 试验设定、假设以及检验统计量 241 13.1.1 试验设定与假设 241 13.1.2 全局假设的检验统计量 242 13.2 把握度和样本量估计 245 13.3 对每一个剂量进行的单个假设检验 249 13.4 基于两阶段 p 值组合的检验 250 附录 13.1 Ⅱ / Ⅲ期无缝选择优胜者设计下的样本量估计 R 程序 250 作业 13.1 252 作业 13.2 252 作业 13.3 252 作业 13.4 252 作业 13.5 252 作业 13.6 253 作业 13.7 253 作业 13.8 253 参考文献 253 14 统计学显著性和 p 值 255 14.1 启发性问题 255 14.2 区分 p 值与 Neyman-Pearson 二分类决策 256 14.3 重复试验也出现“显著性”结果的概率 256 14.4 p 值和处理效应的估计 258 14.5 不同样本量的重复试验 258 14.6 p 值的分布 259 14.7 衡量零假设 H0 的证据 261 14.8 结论 263 附录 14.1 图 14.1 所用的 R 程序 264 附录 14.2 图 14.2 所用的 R 程序 264 附录 14.3 通过设置δ/σ的先验分布来模拟估计相同样本量的重复试验得到显著性结果的概率——R 程序 265 作业 14.1 265 作业 14.2 265 作业 14.3 265 参考文献 266 15 估计目标、伴发事件和缺失数据 267 15.1 研究目的与决策者 267 15.2 伴发事件与估计目标 268 15.3 缺失数据基础——模式和机制 271 15.4 缺失数据的可忽略性与不可忽略性 272 15.5 随机缺失假设下的多重填补分析 274 15.6 随机缺失假设下单调缺失模式的纵向数据分析 275 15.7 非随机缺失 - 非未来依赖型(NMAR-NFD)模型假设下使用多重填补的敏感性分析 277 15.7.1 带有均值漂移校正的 NFD 277 15.7.2 使用伴发事件类型或初始处理停用原因以及随访时间进行均值漂移校正的 NFD 形成缺失数据模式 280 15.8 其他非随机缺失模型下的敏感性分析 281 15.8.1 基于参考药物的填补方法 281 15.8.2 共享参数或随机系数依赖模型 282 附录 15.1 抽样分布推断 282 附录 15.2 似然推断 283 附录 15.3 贝叶斯推断 283 附录 15.4 接近随机缺失和随机缺失的选择模型与模式混合模型的等价性 284 附录 15.5 NFD 缺失机制——具有单调缺失数据模式的纵向数据 NMAR 子类 285 附录 15.6 选择模型下的 NFD 缺失条件(式 15A.10)与模式混合模型下的 NFD缺失条件(式 15A.12)之间的等价性 287 作业 15.1 287 作业 15.2 287 作业 15.3 288 作业 15.4 288 作业 15.5 288 作业 15.6 288 参考文献 289
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