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生物科学

非编码RNA的功能与预测:剪切后内含子潜在的生物学功能

作者：赵小庆，李宏，路战远主编

出版社：中国农业出版社出版时间：2023-07-01

开本： 16开

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内容简介
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作者简介

非编码RNA的功能与预测:剪切后内含子潜在的生物学功能版权信息

ISBN：9787109309364
条形码：9787109309364 ; 978-7-109-30936-4
装帧：暂无
册数：暂无
重量：暂无
所属分类：
自然科学
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生物科学

非编码RNA的功能与预测:剪切后内含子潜在的生物学功能内容简介

非编码RNA是基因组“暗物质”的重要组成部分，基因表达及生命新陈代谢调控网络系统的关键环节，剪切后内含子就是一类*重要和*特殊的非编码RNA。通过系统研究剪切后内含子与相应mRNA匹配分布规律及作用机制，揭示剪切后内含子主体功能因子的弱调控作用对探索剪切后内含子的生物学功能甚至其他ncRNA的功能具有里程碑式的意义。本书研究成果可为现在动植物分子育种、病害检测与治理、种质资源系统进化与鉴定提供新的思路和手段，也可为人类健康与疾病预防等提供新的途径和独特视野。

非编码RNA的功能与预测:剪切后内含子潜在的生物学功能目录

序 **章绪论 1.1 研究背景 1.2 真核基因的内含子特征 1.2.1 AG-GT型内含子的特征 1.2.2 AT-AC型内含子的特征 1.3 内含子的进化 1.3.1 内含子的起源 1.3.2 内含子的获得与丢失 1.4 内含子的功能 1.4.1 内含子的生物学功能 1.4.2 内含子对mRNA的代谢功能 1.5 剪接体内含子促进逆境下细胞生存 1.6 ncRNA调控基因表达的功能 1.6.1 siRNA 1.6.2 microRNA (miRNA) 1.6.3 piRNA 1.6.4 长非编码RNA 1.6.5 环状RNA 1.6.6 剪切后内含子第二章研究方法 2.1 全局比对 2.2 mRNA折叠 2.3 碱基匹配局域比对方法 2.4 结合自由能加权局域比对方法 2.5 新对称相对熵局域进化关联方法 2.6 区域匹配频率分布统计方法 2.7 信息熵分析 2.8 对照序列构建方法第三章线虫核糖核蛋白基因内含子与其相应编码序列的相互作用 3.1 数据库 3.2 三类内含子序列上的匹配频率分布 3.2.1 三类内含子序列上与编码序列的匹配频率分布 3.2.2 三类内含子序列上与相应外显子序列的匹配频率分布 3.3 长、短内含子序列上的匹配频率分布 3.4 编码序列上与相应的内含子序列的匹配频率分布 3.5 长、短内含子的序列特征 3.6 结果与讨论 3.6.1 结果 3.6.2 讨论第四章低等真核生物核糖核蛋白基因内含子与相应编码序列的相互作用 4.1 数据库 4.2 内含子的匹配频率分布 4.2.1 不同内含子位置的匹配频率分布 4.2.2 长、短内含子的匹配频率分布 4.2.3 酵母内含子的匹配频率分布 4.3 编码序列的匹配频率分布 4.4 外显子连接处的匹配频率分布 4.5 序列特征分析 4.5.1 内含子匹配片段的序列特征 4.5.2 内含子匹配区域的序列特征 4.6 结果与讨论 4.6.1 剪接后内含子在基因表达中可能的功能 4.6.2 蛋白因子结合位点的预测 4.6.3 弱相互作用第五章线虫外显子和内含子之间的序列匹配偏好与日C结合区域的关系 5.1 数据集 5.2 匹配片段的序列特征和结构 5.2.1 匹配片段的序列特征 5.2.2 匹配片段的序列结构 5.3 匹配区域对外显子连接序列F值的影响 5.3.1 匹配区域的GC含量对外显子连接序列F值的影响 5.3.2 匹配区域CG二核苷酸对外显子连接序列F值的影响 5.3.3 匹配区域参数Am对外显子连接序列F值的影响 5.4 对比所有内含子 5.5 结果与讨论 5.5.1 EJC结合区域 5.5.2 竞争和协作机制第六章线虫全基因组内含子与其相应编码序列的相互作用 6.1 数据集 6.2 成熟-mRNA序列上相对匹配频率的分布 6.3 功能位点区域上相对匹配频率的分布 6.3.1 AUG区域和UAA区域的匹配频率分布 6.3.2 EE区域的匹配频率分布 6.4 匹配片段的序列特征 6.4.1 配对率和长度分布 6.4.2 G+C含量和D2值 6.5 其他内含子序列与成熟mRNA序列的匹配频率分布 6.6 结论第七章基于结合自由能加权局域比对和新对称相对熵的进化关联比对分析内含子与相应mRNA序列的相互作用关系 7.1 成熟mRNA序列上匹配和相对进化关联频率的分布 7.2 功能位点区域相对匹配和进化关联频率的分布 7.2.1 AUG区域和UAA区域的频率分布 7.2.2 EE区域的相对进化关联频率分布 7.3 匹配和进化关联片段的序列特征 7.3.1 长度和G+C含量分布 7.3.2 碱基关联分析 7.4 结论第八章内含子长度进化机制 8.1 数据集 8.2 内含子序列上匹配频率分布 8.3 内含子序列的进化 8.4 内含子结构特征 8.5 内含子长度进化机制 8.6 结果与讨诊第九章核糖核蛋白基因mRNA序列与相应内含子的序列匹配偏好 9.1 数据集 9.2 mRNA序列上匹配频率分布 9.3 编码序列上匹配频率分布 9.3.1 编码序列的匹配频率分布 9.3.2 翻译起始区域的匹配频率分布 9.3.3 翻译终止区域的匹配频率分布 9.3.4 外显子连接处的匹配频率分布 9.4 结果与讨论第十章内含子与其相应mRNA序列相互作用的普适性分析 10.1 数据集 10.2 mRNA的匹配频率分布 10.3 功能位点附近的匹配频率分布 10.3.1 翻译起始位点的匹配频率分布 10.3.2 翻译终止位点的匹配频率分布 10.3.3 外显子连接处的匹配频率分布 10.3.4 外显子连接处的匹配频率分布 10.3.5 中间外显子连接处的匹配频率分布 10.4 内含子匹配片段的序列特征 10.4.1 配对率和长度分布 10.4.2 GC含量和D2值 10.5 结果与讨论第十一章总结与展望 11.1 工作

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非编码RNA的功能与预测:剪切后内含子潜在的生物学功能作者简介

路战远，1964年生，内蒙古宁城县人，博士学位。现任内蒙古农牧业科学院副院长、研究员、博士生导师。先后主持和参加及省部级等科技项目30余项，获科技进步奖二等奖2项（、4完成人）、省部级一等奖5项（完成人）等科技奖励20余项，获授权专利20余项，制定地方标准10余项。出版专著和主编著作11部、参编著作10余部，发表论文100余篇。先后被授予 “万人计划”百千万工程领军人才、全国农业科研杰出人才、百千万人才工程人选、中青年有突出贡献专家、享受政府特殊津贴专家、全国科技工作者、全国农业科研杰出人才等荣誉称号10余项，在外具有很大的学术影响。

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