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宏基因组学:方法与步骤(原书第二版)

作者：（德）W.R.施特赖持等主编；青岛华大基

出版社：科学出版社出版时间：2023-06-01

开本： B5 页数： 292

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版权信息
内容简介
目录

宏基因组学:方法与步骤(原书第二版) 版权信息

ISBN：9787030757951
条形码：9787030757951 ; 978-7-03-075795-1
装帧：平装胶订
册数：暂无
重量：暂无
所属分类：
自然科学
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生物科学的理论与方法

宏基因组学:方法与步骤(原书第二版) 内容简介

本书共包括19个章节，详细介绍了不同类型环境样本的DNA/RNA提取、以及宏基因组文库构建技术，包括海水环境、低温及碱性特别环境、植物内生环境等；并从核酸、脱氧核酸、蛋白质三个角度分析环境微生物代谢活性；介绍了通过宏基因组测序获得功能基因的分类及多样性的方法，并从基因组学技术层面介绍了复杂微生物群落的研究方法，以及如何挖掘活性基因（如有机物降解基因）并介绍其表达技术与工具，高通量地筛选活性酶基因如水解酶、纤维素酶、新型PHA代谢酶、磷酸酶、氢化酶、N-AHSL干扰酶等；并介绍如何挖掘增加微生物次级代谢的信号。

宏基因组学:方法与步骤(原书第二版) 目录

前言贡献者第1章构建小插入片段和大插入片段的宏基因组文库 1.1 介绍 1.2 实验材料 1.2.1 宏基因组DNA 1.2.2 小片段文库构建 1.2.3 大片段文库构建 1.3 实验方法 1.3.1 小片段宏基因组文库构建 1.3.2 大片段宏基因组文库构建 1.4 注释参考文献第2章从海洋过滤样本提取总DNA与RNA及用于标记基因研究的cDNA通用模板的制备 2.1 介绍 2.2 实验材料 2.2.1 浮游细菌样品 2.2.2 DNA与RNA同时提取 2.2.3 提取的DNA与RNA纯化 2.2.4 DNA消化和PCR对照 2.2.5 **链和第二链合成 2.3 实验方法 2.3.1 从海水滤膜样品中同时提取DNA与RNA 2.3.2 纯化DNA与RNA 2.3.3 **链和第二链合成 2.4 注释参考文献第3章海洋宏基因组大片段文库的构建与筛选 3.1 介绍 3.2 实验材料 3.2.1 取样 3.2.2 宏基因组DNA的分离 3.2.3 16S rDNA系统发生分析 3.2.4 构建宏基因组大片段文库 3.2.5 从宏基因组文库筛选具有群体感应抑制活性的基因 3.3 实验方法 3.3.1 取样流程 3.3.2 宏基因组DNA分离 3.3.3 16S扩增子测序 3.3.4 大片段文库构建 3.3.5 采用PCR扩增对宏基因组文库进行基于序列的筛选 3.3.6 基于功能的宏基因组文库筛选 3.4 注释参考文献第4章寒冷和碱性极端环境宏基因组文库的构建与筛选 4.1 介绍 4.2 实验材料 4.2.1 完整的细胞提取和DNA提取 4.2.2 文库构建 4.2.3 酶活性筛选 4.3 实验方法 4.3.1 从伊卡岩柱样品中获取DNA 4.3.2 文库构建 4.3.3 低温和高pH条件下酶活性的筛选 4.3.4 宏基因组的偏差评估及酶潜力的检测 4.4 注释参考文献第5章基于DNA/RNA/蛋白质的稳定同位素探针技术用于活性微生物标志物的高通量分析第6章植物内生细菌和真菌的多样性评估第7章通过宏基因组鸟枪法测序技术研究复杂微生物群落中的植物软腐病肠杆菌科病原菌第8章来源于宏基因组的基因在变铅青链霉菌中的克隆、表达和发酵优化第9章基于宏基因组数据的降解网络重建第10章宏基因组DNA功能表达的新工具第11章基于微孔板的活性和立体选择性水解酶的筛选第12章基于宏基因组文库的纤维素酶的筛选第13章利用对硝基苯基底物筛选宏基因组文库中辅助性木质纤维素酶的液相复用高通量筛选技术第14章修饰多酚类底物的糖基转移酶的筛选第15章从复杂微生物群落中分离编码新型PHA代谢酶基因的方法第16章基于功能宏基因组文库的磷酸酶活性编码基因的筛选和异源表达第17章基于活性宏基因组文库的氢化酶筛选第18章基于N-AHSL信号的干扰酶筛选第19章挖掘微生物信号分子助力次级代谢产物的生物探索

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