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分子生物学 第4版 版权信息
- ISBN:9787030644244
- 条形码:9787030644244 ; 978-7-03-064424-4
- 装帧:一般胶版纸
- 册数:暂无
- 重量:暂无
- 所属分类:>
分子生物学 第4版 内容简介
“精要速览系列”(InstantNotesSeries)丛书是国外教材“Bestseller”榜的上榜教材。该系列丛书结构新颖,视角独*;重点突出,脉络分明;图表清晰,英文自然易懂,被国内许多所重点院校选作双语教材。 分子生物学第四版是在第三版的基破上修订而成的。《分子生物学=Molecular Biology:第四版》共分19章,分别是:信息大分子,核酸的性质,原核与真核生物的染色体结构,DNA复制,DNA损伤、修复与重组,原核生物的转录,原核生物的转录调控,真核生物的转录,真核生物的转录调控,RNA加工与核糖核蛋白复合体,遗传密码与tRNA,蛋白质合成,噬菌体与真核生物病毒,细胞周期与癌症,基因操作技术,克隆载体,基因文库与筛选,克隆DNA的分析与应用,功能基因组学及其新技术。
分子生物学 第4版 目录
第四版前言
缩略词
A 信息大分子 1
A1 信息加工与分子生物学 1
A2 核酸结构与功能 1
A3 蛋白质结构与功能 2
A4 大分子组装 4
A5 蛋白质分析方法 4
B 核酸的性质 38
B1 核酸的理化特性 38
B2 核酸的光谱学和热力学特性 38
B3 DNA超螺旋 39
C 原核与真核生物的染色体结构 52
C1 原核生物的染色体结构 52
C2 染色质结构 52
C3 真核生物的染色体结构 53
C4 基因组复杂度 54
D DNA复制 75
D1 DNA复制概述 75
D2 细菌的DNA复制 75
D3 真核生物的DNA复制 76
E DNA损伤、修复与重组 91
E1 DNA损伤 91
E2 诱变 91
E3 DNA修复 92
E4 重组与易位 93
F 原核生物的转录 112
F1 转录的基本原理 112
F2 大肠杆菌RNA聚合酶 112
F3 大肠杆菌σ70启动子 113
F4 转录的起始、延伸与终止 113
G 原核生物的转录调控 129
G1 乳糖操纵子 129
G2 色氨酸操纵子 129
G3 不同σ因子和非编码RNA对转录的调控 130
H 真核生物的转录 145
H1 三种RNA聚合酶:特性及其功能 145
H2 RNA聚合酶Ⅰ基因:核糖体重复 145
H3 RNA聚合酶Ⅲ基因:5S基因与tRNA基因的转录 146
H4 RNA聚合酶Ⅱ基因:启动子与增强子 147
H5 通用转录因子与RNA聚合酶Ⅱ的起始 148
I 真核生物的转录调控 167
I1 真核生物的转录因子 167
I2 转录调控案例 168
J RNA加工与核糖核蛋白复合体 183
J1 rRNA加工与核糖体 183
J2 tRNA及其他小RNA的加工 184
J3 mRNA加工、hnRNP和snRNP 185
J4 可变mRNA加工 186
K 遗传密码与tRNA 209
K1 遗传密码 209
K2 tRNA结构与功能 210
L 蛋白质合成 223
L1 蛋白质合成概述 223
L2 蛋白质合成机制 223
L3 真核生物蛋白质合成的起始 224
L4 翻译调控与翻译后加工 225
M 噬菌体与真核生物病毒 249
M1 病毒简介 249
M2 噬菌体 249
M3 DNA病毒 250
M4 RNA病毒 250
N 细胞周期与癌症 268
N1 细胞周期 268
N2 癌基因 269
N3 肿瘤抑制基因 269
N4 凋亡 270
O 基因操作技术 289
O1 DNA克隆概述 289
O2 质粒DNA的制备 289
O3 限制性酶与电泳 290
O4 连接、转化与重组子分析 290
P 克隆载体 313
P1 质粒载体的设计 313
P2 噬菌体载体、黏粒、YAC及BAC 313
P3 真核生物载体 314
Q 基因文库与筛选 334
Q1 基因组文库 334
Q2 cDNA文库 334
Q3 筛选流程 335
R 克隆DNA的分析与应用 346
R1 克隆的鉴定 346
R2 核酸测序 346
R3 聚合酶链反应 347
R4 克隆基因的分析 348
R5 克隆基因的诱变 349
S 功能基因组学及其新技术 374
S1 组学概述 374
S2 基因表达的整体分析 374
S3 蛋白质组学 375
S4 细胞与分子成像 376
S5 基因转移与干细胞技术 377
S6 生物信息学 377
S7 系统与合成生物学 378
进一步阅读文献 419
Contents
Preface to the fourth edition
Section A – Informational macromolecules
A1 Information processing and molecular biology 6
A2 Nucleic acid structure and function 9
A3 Protein structure and function 17
A4 Macromolecular assemblies 27
A5 Analysis of proteins 31
Section B – Properties of nucleic acids
B1 Chemical and physical properties of nucleic acids 40
B2 Spectroscopic and thermal properties of nucleic acids 44
B3 DNA supercoiling 47
Section C – Prokaryotic and eukaryotic chromosome structure
C1 Prokaryotic chromosome structure 56
C2 Chromatin structure 59
C3 Eukaryotic chromosome structure 64
C4 Genome complexity 70
Section D – DNA replication
D1 DNA replication: an overview 77
D2 Bacterial DNA replication 82
D3 Eukaryotic DNA replication 87
Section E – DNA damage, repair, and recombination
E1 DNA damage 94
E2 Mutagenesis 98
E3 DNA repair 102
E4 Recombination and transposition 107
Section F – Transcription in bacteria
F1 Basic principles of transcription 115
F2 Escherichia coli RNA polymerase 118
F3 The E. coli δ70 promoter 121
F4 Transcription initiation, elongation, and termination 124
Section G – Regulation of transcription in bacteria
G1 The lac operon 132
G2 The trp operon 136
G3 Transcriptional regulation by alternative δ factors and RNA 141
Section H – Transcription in eukaryotes
H1 The three RNA polymerases: characterization and function 149
H2 RNA Pol I genes: the ribosomal repeat 152
H3 RNA Pol III genes: 5S and tRNA transcription 156
H4 RNA Pol II genes: promoters and enhancers 160
H5 General transcription factors and RNA Pol II initiation 163
Section I – Regulation of transcription in eukaryotes
I1 Eukaryotic transcription factors 170
I2 Examples of transcriptional regulation 177
Section J – RNA processing and RNPs
J1 rRNA processing and ribosomes 187
J2 tRNA and other small RNA processing 193
J3 mRNA processing, hnRNPs, and snRNPs 197
J4 Alternative mRNA processing 204
Section K – The genetic code and tRNA
K1 The genetic code 211
K2 tRNA structure and function 216
Section L – Protein synthesis
L1 Aspects of protein synthesis 227
L2 Mechanism of protein synthesis 231
L3 Initiation in eukaryotes 238
L4 Translational control and post-translational events 243
Section M – Bacteriophages and eukaryotic viruses
M1 Introduction to viruses 252
M2 Bacteriophages 255
M3 DNA viruses 260
M4 RNA viruses 264
Section N – Cell cycle and cancer
N1 The cell cycle 271
N2 Oncogenes 276
N3 Tumor suppressor genes 281
N4 Apoptosis 285
Section O – Gene manipulation
O1 DNA cloning: an overview 292
O2 Preparation of plasmid DNA 297
O3 Restriction enzymes and electrophoresis 301
O4 Ligation, transformation, and analysis of recombinants 306
Section P – Cloning vectors
P1 Design of plasmid vectors 316
P2 Bacteriophages, cosmids, YACs, and BACs 321
P3 Eukaryotic vectors 329
Section Q – Gene libraries and screening
Q1 Genomic libraries 336
Q2 cDNA libraries 339
Q3 Screening procedures 343
Section R – Analysis and uses of cloned DNA
R1 Characterization of clones 350
分子生物学 第4版 节选
A 信息大分子 A1 信息加工与分子生物学 要点 中心法则 中心法则的*初观念是从DNA转录成RNA,再翻译成蛋白质,其中转录与翻译是分别进行的。虽然有很多例子与其有相矛盾的地方,但它基本上是正确的。反转录病毒能将RNA反转录为DNA,很多病毒能直接以RNA为模板复制RNA,而一些RNA在合成后能进一步被编辑,以致它们的*终序列不直接由DNA序列所决定。 重组DNA技术 对微生物、动物及植物的基因组进行测序和操作的能力大大提升了我们对细胞生物学的理解。在此基础上,导入外源DNA的转基因技术已广泛地应用在医药、农业和工业等领域。合成新型的基因组的能力必将促进这些领域的进步。 相关主题 核酸结构与功能(A2)真核生物的转录(H) 蛋白质结构与功能(A3)遗传密码与tRNA(K) 原核生物的转录(F) 蛋白质合成(L) A2 核酸结构与功能 要点 碱基 DNA含有4种杂环碱基:嘌呤类有腺嘌呤(A)和鸟嘌呤(G),嘧啶类有胞嘧啶(C)和胸腺嘧啶(T);而在RNA中尿嘧啶(U)替代了结构非常相似的胸腺嘧啶。 核苷 核苷由碱基共价结合于戊糖分子的1′位而构成。RNA中的戊糖为核糖(ribose),构成核糖核苷(ribonucleotide,简称核苷);而在DNA中戊糖为2′-脱氧核糖(2′-deoxyribose),形成2′-脱氧核糖核苷(2′-deoxyribonucleotide,简称脱氧核苷)。碱基+糖分子=核苷。 核苷酸 核苷酸由一个或多个磷酸基团共价结合在核苷的3′位、5′位或2′位(在核糖核苷中)而形成,即碱基+糖分子+磷酸分子=核苷酸。RNA和DNA分别由相应的5′-三磷酸核苷,即5′-三磷酸核糖核苷(NTP)或5′-三磷酸脱氧核糖核苷(dNTP)构成。 磷酸二酯键 核酸链中,核糖或脱氧核糖的5′位与相邻的另一个戊糖的3′位间由磷酸介导形成3′,5′-磷酸二酯键。因此,核酸由具有方向性的戊糖-磷酸骨架及与戊糖分子1′位相连的碱基构成,其重复单位是单个核苷酸。由于磷酸分子带负电荷,核酸成为具有强负电性的多聚大分子。 DNA/RNA序列 核酸序列通常在DNA中是指碱基A、C、G、T的排列顺序,而在RNA链中则是指A、U、C、G的排列顺序。习惯上从分子游离的5′端写至3′端,如5′-ATAAGCTC-3′(DNA)或5′-AUAGCUUGA-3′(RNA)。 DNA双螺旋 DNA分子通常以双螺旋形式存在。两条独立的反向平行的单链?DNA分子以右手螺旋方式相互缠绕,戊糖-磷酸骨架在外,碱基在内。碱基靠氢键相互配对并堆积在一起。腺嘌呤(A)与胸腺嘧啶(T)配对,而鸟嘌呤(G)则与胞嘧啶(C)配对。两条链是互补的,一条链可特异地决定另一条链的序列。 A型、B型及Z型螺旋 虽然沃森与克里克所发现的标准的DNA双螺旋(即B型)被认为是细胞中占优势的DNA结构,但核酸也可以形成右手A型螺旋,体内的RNA链可采用这一形式;而左旋Z型螺旋只在特殊碱基序列处形成,这在细胞中也许并不是一个重要的构象。 RNA二级结构 大部分RNA分子以单链形式存在,可折叠成各种复杂构象,包括局部分子内碱基配对,以及由其他氢键相互作用而维系的构象。这样的复杂性正反映出RNA在细胞中要承担多种作用。 核酸的修饰 核酸的共价修饰在细胞中具有特定作用。对DNA而言,修饰通常仅局限于腺嘌呤和胞嘧啶的甲基化(methylation),而对RNA而言,其修饰范围要大得多。 核酸的功能 DNA只是可以表达出来的遗传信息的载体,而构象多变的RNA在遗传信息的储存、传递及加工的调控和机制方面发挥着各种各样的结构与功能作用。 相关主题 核酸的理化特性(B1) DNA超螺旋(B3) 核酸的光谱学和热力学特性(B2)原核与真核生物的染色体结构(C) A3 蛋白质结构与功能 要点 氨基酸结构 蛋白质中已发现的20种常见氨基酸都有一个与质子、氨基、羧基相连的手性α碳原子和具有不同理化特性的侧链。这些侧链可以是碱性的(带正电荷)、酸性的(带负电荷)、疏水性的(带脂肪族或芳香族基团)或是其他特定基团,如羟基、氨基或巯基。氨基酸在溶液中表现为两性离子。除去两种明显特例外,蛋白质中的稀有氨基酸通过翻译后修饰生成。 蛋白质的大小与形状 包括许多酶在内的球蛋白,在溶液中以紧凑的、近似球形的颗粒形状发生反应。纤维蛋白有一个高轴比,往往具有结构重要性,如丝蛋白(fibroin)和角蛋白(keratin)。蛋白质大小可以为几千到几百万道尔顿。一些蛋白质常与非蛋白性成分相结合,如脂类、糖或某些较小的辅因子。 一级结构 氨基酸在α-羧基与α-氨基间以肽键相连,形成的多肽序列有一个N端和一个C端。以这种方式相连的多肽序列通常有100~1500个氨基酸。 非共价相互作用 大量的弱相互作用维持着蛋白质的三维结构。电荷与电荷、电荷与偶极、偶极与偶极之间的相互作用构成了全部或部分带电原子间的吸引力。氢键和疏水作用力也对维持蛋白质的三维结构起重要的作用。 二级结构 多肽可以折叠成一系列规则的结构,右手α螺旋每圈有3.6个氨基酸,通过肽链的N—H与相隔3个残基的C==O基团间形成氢键,以稳定其整体结构。在肽链的不同部位,由形成的氢键来稳定平行与反平行的β折叠片层结构。 三级结构 二级结构的特定区域及其连接区可组合折叠成一个明晰的三级结构,结果是绝大多数亲水性氨基酸暴露在外表面,而疏水性氨基酸则聚集在内部,通过非共价相互作用,有时是由二硫键来稳定其结构。变性往往导致二级结构和三级结构的丧失。 四级结构 许多蛋白质有多于一个的肽链亚基,如血红蛋白有两条α链和两条β链。像微管这样的巨大复合体是由单一肽链的四元复合体组成的。别构效应通常取决于亚基的相互作用。 辅基 某些蛋白质可与提供额外化学功能的非蛋白质分子(辅基,prosthetic group)相结合。辅基包括烟酰胺二核苷酸(NAD+)、血红素及如Zn2+等金属离子。 结构域、基序、家族与进化 结构域是在一个单一肽链中形成的半独立的结构和功能单元。新的蛋白质可以通过结构域间的重新组合而产生。基序是蛋白质家族相关成员中的一级或二级结构元件的组合。蛋白质家族通过基因复制和随后的新基因趋异进化而产生。 蛋白质的功能 蛋白质具有广泛的功能:它们可以以酶、抗体、细胞内外的结构元件、受体、化学配体的转运子、调节子或营养贮存体的形式起作用。 相关主题 大分子组装(A4) 蛋白质合成(L) A4 大分子组装 要点 大型的蛋白质复合体 蛋白质之间可以相互连接形成分子质量巨大的结构。真核生物细胞骨架就是由各种蛋白质复合体构成的,这些蛋白质复合体包括微管(由微管蛋白构成)、微丝、肌肉纤维(肌动蛋白和肌球蛋白)、纤毛和鞭毛。这些蛋白质复合体决定细胞及亚细胞器的形状与运动。 结合蛋白 糖蛋白与蛋白多糖(mucoprotein)是以共价键与糖类相连的蛋白质结合体,通常位于细胞外表面及胞外间隙。脂蛋白常被用来在水环境中运送脂类分子。像这样的混合大分子结合体提供了比其组分单独存在时更多的功能。 核蛋白 细菌70S核糖体由一个50S大亚基和一个30S小亚基组成。前者含有23S和5S核糖体RNA(rRNA)分子及31种蛋白质,后者包含一个16S rRNA分子与21种蛋白质。真核生物的80S核糖体含有60S(28S rRNA、5.8S rRNA和5S rRNA)和40S(18S rRNA)两个亚基。染色质含有DNA和碱性组蛋白。病毒也是一种核蛋白复合体。 膜 膜磷脂和鞘脂形成了极性基团在外部、烃链在内部的双分子层。膜蛋白可能是外周蛋白或整合蛋白,并起着受体、酶、转运蛋白或细胞相互作用介质的作用。 相关主题 蛋白质结构与功能(A3) rRNA加工与核糖体(J1) 染色质结构(C2) 噬菌体与真核生物病毒(M) A5 蛋白质分析方法 要点 重组蛋白质的制备 从生物细胞提取物中纯化蛋白质通常效率低下且费力,因此现在通常将编码蛋白质的基因插进表达载体,在合适的宿主细胞中来表达。将序列标签加到重组蛋白质上来简化蛋白质的纯化与检测,从而提高效率。用真核宿主-载体系统来表达可获得正确的翻译后修饰。 蛋白质测序 用特异的蛋白酶将多肽切割成较小的肽段后,可通过化学方法或质谱方法对肽段进行氨基酸序列测定。从特异性不同的蛋白酶切片段所产生重叠序列可以再现原蛋白质的全长序列。不过,从蛋白质编码基因或互补DNA(cDNA)序列来预测蛋白质全序列要相对简单得多。 生物物理方法 许多蛋白质可以被结晶,进而利用X射线衍射可以确定它们的三级结构。溶液中的低分子质量蛋白质可用多维核磁共振(multi-dimensional nuclear magnetic resonance)来确定其结构,特别是正常的12C和14N若被13C和15N取代后更易进行。还有许多其他技术可被用来研究蛋白质结构和相互作用。 分子质量的测定和质谱分析 通过SDS存在下的凝胶电泳能够获得蛋白质的大致分子质量。用电喷雾电离(electrospray ionization,ESI)质谱可以给出精确到0.01%以内的蛋白质分子质量。质谱也能检测蛋白质的翻译后修饰。 抗体应用 抗体是脊椎动物的免疫系统为了应对外来物质(抗原,如注射蛋白)入侵而产生的蛋白质。由于抗体对蛋白抗原有很高的结合亲和力和特异性,因此已成为很有用的实验室工具,借助于免疫荧光、免疫印迹及免疫共沉淀来对蛋白质进行检测与分析。 功能分析 对于一个蛋白质进行功能分析包括对它进行分离纯化,在体外分析其功能,以及在突变体中由于基因突变或缺失而使蛋白质功能缺失来研究该蛋白质的行为。有时也可以通过与已知蛋白质的序列和结构进行比较,来预测一个新蛋白质的功能。 相关主题 核酸结构与功能(A2)蛋白质组学(S3) 蛋白质结构与功能(A3) 生物信息学(S6) A1 Information orocessina and molecular biology Key Notes The ‘central dogma’ The central dogma is the original proposal that ‘DNA makes RNA makes protein,’ which happens via the processes of transcription and translation respectivel. This is broadly correct, although a number of examples are known that contradict parts of it. Retroviruses reverse transcribe RNA into DNA, other viruses can replicate RNA directly into an RNA copy, whereas some RNAs can be edited after synthesis so that the resulting sequence is not directly specified bythe DNA sequence. Recombinant DNA technology The ability to sequence and manipulate the genomes of microorganisms, animals, and pl
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