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生物科学

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生物科学的理论与方法

现代生物学数据分析原理与应用

作者：梅步俊，王贵

出版社：中国农业科学技术出版社出版时间：2019-11-01

开本： 26cm 页数： 235页

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版权信息
本书特色
内容简介
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作者简介

现代生物学数据分析原理与应用版权信息

ISBN：9787511644299
条形码：9787511644299 ; 978-7-5116-4429-9
装帧：平装-胶订
册数：暂无
重量：暂无
所属分类：
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生物科学的理论与方法

现代生物学数据分析原理与应用本书特色

分子生物学发展到今天已有几十年的时间，从单个基因 real－time PCR检测到几万个基因同时检测的芯片技术；从单个片段 sanger法测序到百千万个 reads的高通量测序技术，分子生物学的检测通量正在从单点分析过渡到大规模全面检测和分析。不仅仅在分子生物学领域，近十几年互联网和计算机技术的高速发展使得在生物学日常生产和科研活动中产生的数据量也呈现极大增长。然而目前现状是具备专业知识的广大生物学工作者虽然能够利用 Excel、SPSS等软件进行一般的数据分析，但对于较大规模的数据和专业格式文件等往往束手无策。本书共分十四章，从Linux系统基本操作、统计遗传学基础原理到高通量数据分析。目的是让非计算机专业的生物学工作人员能够较快地学会信息分析和数据处理的方法与技巧，并可以自己动手完成相关数据工作。

现代生物学数据分析原理与应用内容简介

本书共分十章, 从Linux系统基本操作、统计遗传学基础原理到高通量数据分析。内容包括: R语言在生物信息学中的应用、二代测序数据深度挖掘与展示、转录组深度分析等。

现代生物学数据分析原理与应用目录

**章 R语言在生物信息学中的应用 **节基因组数据的图形展示与说明一、散点图二、直方图三、盒形图四、饼状图五、柱状图六、组合图七、基因组大小与基因含量的散点图及线性回归例子八、绘制包含多种图形类型的R生物图形第二节高分辨率论文图片制作第三节 ggplot或ggplot2 第四节 GWAS理论第五节统计遗传学基因组数据格式举例第六节 Missing heritability第二章二代测序数据深度挖掘与展示一、高通量测序绘图的特点二、基础图形类型三、散点图是典型的二维图四、折线图五、盒形图六、PcA的几何解释七、热图分析——展示+聚类八、地图九、生存分析图十、点图十一、散点图之火山图十二、气泡图十三、pathway富集展示图十四、WGCNA分析练习一、绘制MAplot图二、气泡图三、折线图与频率直方图四、共表达网络构建五、WGCNA网络构建六、如何进行差异基因分析第三章转录组深度分析 **节应用举例一、时间序列的基因共表达网络构建二、基因共表达分析三、Cytoscape网络关系展示。以及表达分析第二节如何进行差异分析及挑选P值第四章动物育种中的线性模型一、主要内容二、矩阵代数(matrix algebra)基础知识第五章动物育种中的线性模型二线性模型基础第六章遗传参数估计一、传统的估计方法二、基于线性混合模型估计遗传参数练习第七章 *佳线性无偏预测(BLUP) 一、预测和估计二、线性混合模型(Linear mixed model) 三、动物模型BLUP(Animal model BLUP) 练习第八章其他模型下的BLUIP 一、重复力模型二、母体效应三、公畜模型(sire model) 四、公畜一母畜模型(sire—dam model) 五、外祖父模型(maternal grandsire model) 六、随机回归模型(random regression model，RRM) 七、多性状动物模型BLUP第九章 BLUP用于基因组育种值估计一、基因组选择的基本过程二、RR—BLUP(ridge regression BLUP) 三、GBLUP(genomic BLUP) 四、A矩阵vs G矩阵五、ss—GBLUP(Single—step GBLUP) 六、Bayesian alphabets 七、GEBV的准确性练习第十章贝叶斯统计在动物育种中的应用一、马尔科夫蒙特卡罗(MCMC) 二、贝叶斯推断在线性模型中的应用三、R语言代码

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现代生物学数据分析原理与应用作者简介

梅步俊(1978-)，男，汉族，出生于内蒙古自治区呼和浩特市，副教授；现任河套学院农学系动物科学教研室副主任(正科)；2006年9月~2009年7月就读于内蒙古农业大学动物科技学院，所学专业为动物遗传育种与繁殖，获农学博士学位；2009年10月~2012年8月于中国农业大学动物科技学院做博士后研究，从事畜禽统计基因组学研究；2015年6月~2016年7月在美国爱荷华州立大学动物科学系做访问学者；在国内外期刊发表论文20余篇，获得10项计算机软件著作权，出版著作一部。王贵，河套学院农学系教授，荣获内蒙古自治区农牧业丰收一等奖，中青年科技人オ突出贡献奖，通辽市科技进步奖二等奖，巴彦淖尔市自然科学奖，万名科学使者进社区科技部一等奖，《当代教育实践与教学研究》编辑部论文一等奖，《当代教育实践与教学研究》编辑部论文一等奖。

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