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骆驼基因组学研究
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骆驼基因组学研究

作者：吴慧光
出版社：中国农业科学技术出版社出版时间：2016-12-01
开本： 16开 页数： 176
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骆驼基因组学研究 版权信息

  • ISBN：9787511636416
  • 条形码：9787511636416 ; 978-7-5116-3641-6
  • 装帧：一般胶版纸
  • 册数：暂无
  • 重量：暂无
  • 所属分类：
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    动物学

骆驼基因组学研究 本书特色

阿拉善双峰驼基因组学研究一书重点介绍了阿拉善双峰驼饲养特点，从阿拉善双峰驼基因组和宏基因组不同的研究方法角度，分析阿拉善双峰驼*基因组和第二基因组的特点，为实现阿拉善双峰驼遗传资源的开发提供理论指导。

骆驼基因组学研究 内容简介

阿拉善双峰驼基因组学研究一书重点介绍了阿拉善双峰驼饲养特点，从阿拉善双峰驼基因组和宏基因组不同的研究方法角度，分析阿拉善双峰驼**基因组和第二基因组的特点，为实现阿拉善双峰驼遗传资源的开发提供理论指导。

骆驼基因组学研究 目录

第1章引言

11研究背景和意义

12国内外研究进展

121骆驼科动物的进化

122现存骆驼科动物的生物学特性

123生物信息学及其发展历史

124基因组测序技术

13研究内容

第2章骆驼科动物全基因组序列的测序与组装

21材料与方法

211试验材料

212DNA提取及检测

213基因组测序

214测序数据过滤

215K-mer分析估计基因组大小

216小片段数据纠错

217骆驼科动物基因组的组装

218骆驼科动物基因组的测序效果评价

22 结果与分析

221DNA样品检测结果

222基因组测序结果

223测序数据过滤结果

224K-mer分析估计基因组大小的结果

225小片段数据纠错的结果

2263个骆驼科动物基因组的组装结果

2273个骆驼科动物基因组的组装后基因组分析

23讨论

231测序物种的选择

232测序平台与策略

233基因组大小的估计

234基因组的组装指标

24本章小结

第3章骆驼科动物的基因组注释

31材料与方法

311试验材料

312重复序列注释

313基因预测

314功能注释

315ncRNA注释

316基因集评估

317直系同源关系分析

32结果与分析

321重复序列注释统计结果

322基因预测统计结果

323功能注释统计结果

324ncRNA注释统计结果

325基因集评估统计结果

326直系同源关系分析结果

33讨论

331骆驼科动物基因组重复序列的注释

332骆驼科动物基因组基因结构的预测

333骆驼科动物基因组基因功能和非编码RNA的注释

34本章小结

第4章骆驼科动物基因组进化分析

41材料与方法

411试验材料

412共线性鉴定

413片段复制分析

414基因家族聚类分析

415物种进化树的构建

416物种分歧时间的计算

417分支特异性Ka/Ks率计算

418SNP判读和分布比较分析

419群体历史重建

42结果与分析

421共线性鉴定结果

422片段复制分析结果

423基因家族聚类分析结果

424物种进化树的构建结果

425物种分歧时间的计算结果

426分支特异性Ka/Ks率计算结果

427SNP判读和分布比较分析结果

428群体历史重建结果

43讨论

431骆驼科动物基因组的共线性与片段复制

432骆驼科动物进化关系和分歧时间推算

433骆驼科动物的选择压力

434骆驼科动物的群体历史规模的变化

44本章小结

第5章骆驼沙漠适应性的比较基因组学分析

51材料与方法

511试验材料

512基因家族收缩扩张分析

513正选择分析

514包含特异氨基酸变异的蛋白筛查

515基因获得和缺失

516快速进化

52结果与分析

521基因家族收缩扩张分析结果

522正选择分析结果

523包含特异氨基酸变异的蛋白筛查结果

524基因获得和缺失结果

525快速进化基因结果

53讨论

531骆驼能量代谢

532骆驼应激能力

533骆驼对沙尘和日照的适应性

534骆驼对缺水的适应性

54本章小结

第6章双峰驼肾脏的转录组分析

61材料与方法

611试验材料及试验处理

612RNA提取及检测

613RNA样品处理与测序

614转录组数据过滤

615基因表达水平计算

616差异表达基因筛选

617差异表达基因的GO功能显著性富集分析

618差异表达基因的通路显著性富集分析

62结果与分析

621RNA提取检测结果

622转录组测序的碱基组成和碱基质量分析结果

623双峰驼肾脏转录组基本分析结果

624双峰驼肾脏转录组基因表达注释结果

625双峰驼肾脏转录组基因差异表达分析结果

626双峰驼肾脏转录组差异表达基因的GO分析结果

627双峰驼肾脏转录组差异表达基因的通路富集分析结果

63讨论

631骆驼肾脏钠重吸收相关基因的转录特点

632骆驼肾脏水孔蛋白基因家族转录特点

633骆驼肾脏的高渗调节特点

634骆驼肾髓质有机适应性渗透物的调节

635骆驼肾髓质的渗透调节与血糖

636骆驼肾髓质的渗透保护

64本章小结

第7章全书总结

71全书结论

72研究创新点

73有待进一步研究的内容

731基因组组装版本的更新

732基因组注释工作的完善

733骆驼科动物进化基因的研究

734骆驼肾脏生理的分子和细胞学研究

缩略词表

附录

参考文献
展开全部

骆驼基因组学研究 作者简介

吴慧光，男，1980年生，博士，现美国俄亥俄州立大学博士后，主要从事阿拉善双峰驼基因组学研究。主持国家级项目1项，省级项目2项，校级项目2项，参加项目多项。发表论文多篇，其中第一作者发表《NatureCommunication》1篇。获得市级奖励2项，校级奖励2项。

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